Ярославский государственный аграрный университет является единственным высшим учебным заведением Ярославской области по подготовке специалистов сельскохозяйственного производства и имеет полувековую историю развития. 

8 марта 1944 года в соответствии с приказом Председателя Всесоюзного комитета по делам высшей школы при Совете Народных Комиссаров СССР на базе Ярославского сельскохозяйственного техникума был организован Ярославский сельскохозяйственный институт. 

Институт состоял из двух факультетов: агрономического и зоотехнического,— на каждый из которых было принято по 70 студентов. 
Первыми студентами института были юноши и девушки из села — работники колхозов и совхозов, а также фронтовики, пришедшие домой. 

Первым помещением Ярославского СХИ было здание школы № 43 по ул. Володарского, на 4-х этажах которого размещалась администрация института, учебные аудитории и небольшое общежитие. 

Первые занятия начались 15 ноября 1944 года. Просуществовал институт 13 лет. За эти годы было подготовлено 848 специалистов сельского хозяйства. Выпускники ЯСХИ оставили заметный след в сельскохозяйственном производстве Ярославской области, участвовали в освоении целинных и залежных земель в Казахстане.

В августе 1957 года Ярославский СХИ был переведен в г. Ворошилов (Уссурийск) Приморского края, ныне Приморская ГСХА. Вместе с институтом на Дальний Восток поехали многие преподаватели и более 300 студентов-ярославцев. 

Через 20 лет начался новый этап возрождения высшего сельскохозяйственного образования на Ярославской земле.

В апреле 1977 года в Ярославле был организован филиал Московской ордена Ленина и ордена Трудового Красного Знамени сельскохозяйственной академии имени К.А. Тимирязева. 

Разместился Ярославский филиал ТСХА в помещении Иваньковской школы-интерната на Тутаевском шоссе. 

Первые занятия начались 1 сентября 1977 года. 
Ярославский филиал ТСХА имел 3 факультета: агрономический, экономический и зооинженерный. На первый курс было зачислено по 75 человек на каждый факультет. Подготовка осуществлялась по 4 специальностям: на агрономическом факультете — по специальности «Агрономия» с квалификацией ученый агроном; на зооинженерном — по специальности «Зоотехния» с квалификацией зооинженер; на экономическом — по двум специальностям — «Экономика и организация сельского хозяйства» и «Бухгалтерский учет, анализ хозяйственной деятельности в сельском хозяйстве» с квалификациями: экономист-организатор сельскохозяйственного производства и экономист по бухгалтерскому учету в сельском хозяйстве, соответственно. 

Первый выпуск специалистов состоялся в 1981 году по специальности «Бухгалтерский учет, анализ хозяйственной деятельности в сельском хозяйстве» и в 1982 году — по всем другим специальностям.

В январе 1978 года было создано подготовительное отделение с набором 75 человек, а в 1983 году было открыто заочное отделение филиала академии. 

В декабре 1990 года Ярославский филиал ТСХА был преобразован в самостоятельный Ярославский сельскохозяйственный институт. 

В мае 1991 года был открыт инженерный факультет и аспирантура. 

В 1995 году ЯСХИ стал государственной сельскохозяйственной академией; 1995 год — Открыт диссертационный совет по защите кандидатских диссертаций по специальности 08.00.05 — Экономика и управление народным хозяйством

1998 год — Открыт диссертационный совет по защите кандидатских диссертаций по специальности 06.02.01 — Разведение, селекция, генетика и воспроизводство сельскохозяйственных животных

2001 год — Открыты новые специальности «Агроэкология», «Технология производства и переработки сельскохозяйственной продукции» 

2002 год – Федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Ярославская государственная сельскохозяйственная академия»

2003 год — Открыты специальности «Финансы и кредит», «Электрификация и автоматизация сельского хозяйства»

2004 год — Открыта специальность «Технология обслуживания и ремонта машин в АПК»

2011 год – Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Ярославская государственная сельскохозяйственная академия»

2015 год – Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Ярославская государственная сельскохозяйственная академия»

2018 год – Открыты новые профили в рамках реализуемых направлений подготовки: «Организация обслуживания транспорта и логистика в АПК», «Кинология», «Лечебное дело»

2018 год - Образован Попечительский совет – совещательный орган, способствующий укреплению сотрудничества с ведущими работодателями отрасли в образовательной и научной сферах

2019 год – Открыта ветеринарная клиника, автошкола

2021 год - научный журнал «Вестник АПК Верхневолжья», учредителем которого является университет, включен в Перечень Высшей аттестационной комиссии (ВАК)

2022 год – Открыто направление подготовки магистратуры «Агроинженерия»

2023 год - Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Ярославский государственный аграрный университет»

Учредителем ФГБОУ ВО «Ярославский ГАУ» является Министерство науки и высшего образования Российской Федерации. Адрес: Россия, 125993, г. Москва, Тверская ул., д.11 Справочная служба тел. +7 (495) 547-13-07, 547-13-16

График работы:

- для руководящего, административно-хозяйственного и обслуживающего персонала, научного, инженерно-технического, учебно-вспомогательного, устанавливается рабочее время с 8.15 до 17.00 час., в пятницу с 8.15 до 16.00 час. Перерыв для отдыха и питания - 33 мин. 

- для профессорско-преподавательского состава установлена тридцатишестичасовая рабочая неделя.